Giovanni B. Varnier ha insegnato nelle Università degli Studi di Urbino, Torino, Macerata e Genova, dove ha ricoperto anche la carica di preside della Facoltà di Scienze Politiche ed ora è Professore emerito.
È autore di ricerche di carattere giuridico-politico e storico, privilegiando la storia delle istituzioni ecclesiastiche in età moderna e contemporanea e i rapporti tra Stato e Chiesa sia a livello di vertice che nei risvolti di carattere locale.
